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La conception et l'application de la justice ont radicalement changé. Au XXIIe siècle, le Japon est régi par le système Sibyl, un mécanisme objectif évaluant le niveau de dangerosité de chaque citoyen en scrutant son état psychique pour y déceler des penchants criminels, une valeur appelée Psycho-Pass. Les Inspecteurs assurent le maintien de l'ordre en éliminant, souvent de manière létale, toute personne affichant la moindre intention malveillante ; ils sont assistés par des Enforcers, d'anciens citoyens devenus criminels latents qui bénéficient d'une liberté restreinte en contrepartie de leur exécution des tâches sombres dévolues aux Inspecteurs. C'est dans ce contexte qu'arrive Akane Tsunemori, une jeune femme animée par une volonté sincère de servir la justice. Cependant, alors qu'elle travaille aux côtés de l'Enforcer Shinya Kougami, un vétéran expérimenté, elle comprend rapidement que les verdicts rendus par le système Sibyl ne sont pas aussi infaillibles que le pensent ses collègues Inspecteurs. Ses convictions fondamentales étant remises en question, Akane se trouve confrontée à la véritable nature de la justice et à la possibilité de son accomplissement au sein d'un système qui pourrait être fondamentalement défaillant.

Un an et demi après les événements de l'original thriller psychologique de science-fiction, Akane Tsunemori continue ses fonctions d'inspectrice en appliquant les verdicts du Système Sibyl. Elle est secondée par de nouveaux exécuteurs ainsi que par Mika Shimotsuki, une inspectrice junior d'une loyauté farouche et inflexible envers Sibyl. Tandis qu'Akane s'interroge sur la nature de son rôle et la légitimité des décisions du système, une nouvelle menace inquiétante fait surface. Une figure mystérieuse a réussi à manipuler le Coefficient de Criminalité, cette valeur issue de scans mentaux permettant à Sibyl d'évaluer l'état psychologique et d'identifier les criminels potentiels. En exploitant cette technique, l'individu assassine un exécuteur, ne laissant qu'un indice énigmatique : les lettres « WC? » inscrites en sang sur un mur. Akane et le reste de la Division 01 se retrouvent rapidement engagés dans un combat mortel contre ce nouvel antagoniste, affrontant une conspiration qui ébranle non seulement l'autorité du Système Sibyl, mais aussi les principes fondamentaux d'Akane.

Quand un camarade de classe lui propose de tester Darwin's Game, une application mobile mystérieuse, la curiosité pousse Kaname Sudou, lycéen, à l'installer. Dès le lancement du programme, un serpent numérique vert jaillit de l'écran pour mordre son cou, le plongeant dans l'inconscience. Il reprend ses esprits à l'infirmerie scolaire, indemne de toute blessure visible, et, après avoir reçu l'ordre de se reposer, il interprète l'incident comme une hallucination avant de regagner son domicile. Cependant, incapable de contenir son intérêt, Kaname rouvre l'application. Ce qui semblait être un jeu de combat standard bascule vers l'horreur lorsque son adversaire virtuel se matérialise dans le monde réel pour l'attaquer avec une lame. En fuyant pour sauver sa vie, Kaname comprend que Darwin's Game n'est pas un simple divertissement, mais un battle royale mortel.

Dans le Japon de la fin des années 1990, les gros titres des journaux sont remplis d'une série de suicides qui partagent un motif inquiétant. Parmi les nombreuses similitudes troublantes, un détail est particulièrement frappant : chaque victime s'est jetée dans la mort depuis l'immeuble Fujou, un gratte-ciel abandonné et délabré qui domine la ville. Shiki Ryougi, une fille au cœur froid vivant dans un appartement vide, croit que ces sombres événements ont une origine surnaturelle. Elle possède elle-même un pouvoir mystique, et avec Touko Aozaki, détective qui fabrique des poupées et est spécialiste en magie, ainsi que son camarade Mikiya Kokotou, qui assiste Touko, Shiki entreprend d'enquêter sur ces incidents. Alors qu'elle parcourt un monde mystérieux, Shiki rassemble les pièces du puzzle pour révéler les sombres vérités cachées derrière ces étranges événements.

Quand Yuri Honjou, 16 ans, voit le crâne d’un homme fendu par une hache, elle s’enfuit en panique, mais se rend compte qu’elle est piégée dans un immeuble abandonné dont toutes les sorties sont mystérieusement bloquées. Désespérée de sortir, elle se fraye un chemin jusqu’au toit, pour se retrouver seule dans un monde aride de gratte-ciel infinis, sans aucun signe de vie. Malgré le désespoir écrasant, Yuri décide de survivre et de chercher son frère après avoir appris qu’il est lui aussi piégé dans cette étrange réalité. Mais des tueurs masqués qui prennent plaisir à la terreur et à la violence lui font douter qu’elle pourra un jour s’échapper vivante.

Après s'être échappés de l'Académie Hope's Peak, Makoto Naegi et ses compagnons survivants rejoignent la Future Foundation, une organisation dédiée à combattre le désespoir. Mais la situation prend un tournant lorsque Naegi est arrêté pour trahison après avoir défendu les Remnants of Despair. Accompagné de Kyouko Kirigiri et Aoi Asahina, il comparaît devant les dirigeants de la Fondation, affrontant un avenir incertain. Les choses empirent lorsque Monokuma infiltre la sécurité, pourtant réputée impénétrable, de l'organisation, annonçant immédiatement le début d'un nouveau jeu de meurtre. Alors que la première victime apparaît comme un présage d'un renouveau du désespoir, Naegi, le Super High School-Level Lucky Student, doit une fois de plus résoudre le mystère tandis que ses camarades tombent un par un. Cependant, sans procès en classe, les règles ont changé : parmi les seize participants désespérés, il n'y a qu'un seul tueur, et la mort de ce dernier mettra enfin fin à ce jeu infernal.

Dans la cité-État de Cremona, un mystérieux justicier connu sous le nom de « Killer B » sème le trouble. Armé d'une lame et doté de capacités surnaturelles, il rend sa propre justice, attirant à la fois admiration et hostilité. Incapable d'appréhender ce hors-la-loi, le Service d'enquête royal (RIS) fait appel à Keith Flick, un détective talentueux mais peu conventionnel, qui a été muté au département des archives après une perte personnelle. Alors que les crimes passent d'exécutions silencieuses de criminels à des attaques élaborées contre des cibles de haut profil, il devient évident que plus d'une personne est derrière ces actes. Avec l'aide de son impulsive coéquipière Lily Hoshina et même de Killer B lui-même, Keith découvre un réseau de conspirations impliquant des organisations secrètes, le terrorisme intérieur et des expériences humaines contraires à l'éthique. Alors que le RIS outrepasse son autorité, l'ampleur réelle de la corruption gouvernementale et la loyauté de ceux qui lui sont les plus proches sont remises en question.

L'inhabituelle classe 77-B de l'Académie Hope's Peak accueille une nouvelle professeure principale, Chisa Yukizome, une ancienne étudiante connue comme la Super High School-Level Housekeeper. Débordante d'énergie et de compétences, elle s'efforce de réparer les relations brisées entre ses divers élèves, parmi lesquels on trouve une princesse, un membre du personnel infirmier, un membre du yakuza et une personne incroyablement chanceuse. Confiante dans la force de l'espoir, elle tente de les guider à travers leurs différends. En parallèle, Hajime Hinata, un étudiant du Reserve Course qui estime ne posséder aucun talent particulier, rencontre Chiaki Nanami, la Super High School-Level Gamer. Au fil de leurs moments passés ensemble, elle lui offre une nouvelle perspective sur la vie. Mais à l'insu de Hajime, l'administration de l'école concocte un sombre complot impliquant ce dernier, qui pourrait entraîner la chute de Hope's Peak et dévaster le monde. Zetsubou-hen suit le quotidien de la célèbre académie tandis que des forces obscures agissent en coulisses. Alors que le désespoir prend peu à peu le pas sur l'espoir, les responsables du Plus Grand, du Plus Affreux, du Plus Tragique Événement de l'Histoire Humaine mettent leur plan à exécution, marquant le début de la fin.

Pour Kimimaro Yoga, étudiant en deuxième année d'économie à l'université, l'argent est le pouvoir – et sans lui, la vie n'a aucune valeur. Vivant dans un pays frappé par un effondrement économique, il se débat pour joindre les deux bouts tandis qu'il voit ses camarades profiter d'une vie relativement confortable. Tout change lorsqu'un homme coiffé d'un haut-de-forme nommé Masakaki apparaît à sa porte tard un soir. Masakaki invite Yoga au District financier de l'Est, un endroit débordant d'argent pour ceux qui acceptent de mettre leur « avenir » en garantie. Bien qu'hésitant, sa cupidité l'emporte sur sa prudence et il accepte, devenant un Entre. Sans qu'il le sache, ce monde de richesse est en réalité un royaume alternatif calqué sur le sien, où les Entres sont forcés à des batailles hebdomadaires appelées Deals, misant leur garantie. Affrontant ses compatriotes et le destin lui-même, Yoga doit rapidement apprendre à survivre dans cette nouvelle réalité – luttant pour protéger à la fois sa fortune et son avenir, et découvrant ce que l'argent vaut vraiment.

Le Système Sibyl permet désormais à la société de mesurer les états mentaux sur une échelle numérique. En utilisant ces « coefficients criminels », les autorités peuvent appréhender un criminel avant même qu'il ne commette un crime. Mais ce système est-il vraiment infaillible ? Pour Kei Mikhail Ignatov et Arata Shindou, qui débutent leur carrière au Département des enquêtes criminelles du Bureau de la Sécurité publique, cette question reste sans réponse. Shindou et Ignatov sont chargés d'enquêter sur l'accident d'un navire transportant des immigrants, et ils commencent à soupçonner que l'incident n'était pas accidentel. En même temps, un mystérieux groupe connu sous le nom de Bifrost les observe depuis l'ombre, et ils ne sont pas les seuls à les surveiller.

À l'hiver 1995, Mikiya Kokutou rencontre une jeune femme lors d'une promenade nocturne dans la neige. Vêtue d'un kimono blanc saisissant avec une expression énigmatique, Shiki Ryougi sourit à Mikiya, qui la regarde avec curiosité. Au printemps suivant, Mikiya aperçoit Shiki lors de la cérémonie d'entrée de son lycée, et ils deviennent connaissances grâce à des déjeuners passés à discuter. Alors que Shiki s'ouvre progressivement à lui, Mikiya apprend son enfance inhabituelle. Pendant ce temps, une série de meurtres sans précédent se produit dans la ville de Mifune. Ces meurtres semblent liés et sont particulièrement violents, ce qui déclenche une enquête policière de grande envergure. Comme son cousin travaille en tant qu'enquêteur de police, Mikiya obtient des informations sur l'affaire. Inquiet pour la sécurité de Shiki, il décide de surveiller ses actions, mais ce faisant, il fait une découverte véritablement choquante qui change sa vie à jamais.

En novembre 1998, un double meurtre a lieu dans le complexe d'appartements Ogawa, nouvellement construit, au centre de la ville de Mifune. Tomoe Enjou, l'auteur du meurtre, s'enfuit paniqué. À sa surprise, la police ne le poursuit pas et l'incident ne fait l'objet d'aucune couverture médiatique. Après que Shiki Ryougi a protégé Tomoe d'un groupe de voyous, elle le laisse se cacher chez elle. Quelques jours plus tard, Tomoe est horrifié de découvrir que sa mère est toujours en vie, alors qu'il est certain de l'avoir tuée. Pendant ce temps, Mikiya Kokutou enquête sur une information que son associée Touko Aozaki a reçue concernant le meurtre dans l'étrange complexe d'appartements. Alors que Mikiya découvre plus de détails sur l'incident, il s'intéresse particulièrement à Tomoe. Décidant d'enquêter davantage sur lui, Mikiya apprend bientôt la vérité troublante derrière le sinistre complexe Ogawa. Le cinquième volet de la série de films Kara no Kyoukai, Mujun Rasen mêle un mystère finement construit aux thèmes et personnages établis pour créer une histoire sombre et qui fait réfléchir.

Gesicht, détective androïde travaillant pour Europol, est chargé de retrouver le tueur de Montblanc, ancien robot de guerre ayant acquis un statut héroïque à la retraite. Bien que le crime semble avoir été commis uniquement par un autre robot, le meurtre d'un éminent défenseur des droits des robots soulève des questions sur l'identité réelle du coupable. Hormis un incident isolé et inexpliqué il y a huit ans, les robots sont programmés pour ne pas pouvoir tuer des humains. Pourtant, la scène de crime ne présente aucune trace humaine, et la méthode correspond suffisamment pour que Gesicht soupçonne que la même entité — qu'elle soit humaine ou robot — est responsable des deux morts. Peu de temps après la mort de Montblanc, un autre robot de guerre d'élite à la retraite est éliminé dans des circonstances mystérieuses. Gesicht remarque un schéma : les deux victimes faisaient partie des sept machines de guerre les plus puissantes jamais construites. Déterminé à empêcher le tueur d'éliminer les cinq vétérans restants, Gesicht sollicite l'aide d'Atom, un androïde de pointe qui ressemble à un garçon humain. Ensemble, ils doivent traquer le meurtrier déchaîné avant que les meurtres ne continuent, ou risquer de causer des dommages irréparables à la société.

En juillet 1998, par une nuit sombre, l'adolescente Fujino Asagami est brutalement agressée et violée par un gang de rue à l'intérieur d'un bar abandonné. Peu importe la quantité de violence physique ou sexuelle qu'ils lui infligent, la fille répond avec la même expression vide et indifférente. Le lendemain, des corps mutilés sont découverts au même endroit, déchiquetés si violemment que les enquêteurs concluent que l'auteur ne peut pas être humain. Pendant ce temps, un client apporte une demande à l'agence de détective de Touko Aozaki, chargeant Shiki Ryougi de capturer ou de tuer le responsable du massacre de la nuit précédente. Bientôt, des rumeurs émergent selon lesquelles un seul survivant a échappé au carnage, et le meurtrier abat maintenant tout sur son passage pour traquer et éliminer ce témoin. Une course acharnée contre la montre commence, alors que Shiki fait face à un ennemi dangereux qui reste invisible même à ses yeux légendaires.

Après les événements de Satsujin Kousatsu (Zen), Shiki Ryougi reste dans le coma pendant deux ans suite à un accident de la circulation. Lorsqu'elle reprend enfin connaissance, elle se retrouve sans aucun souvenir de son passé et est submergée par un profond sentiment d'isolement. Plus inquiétant encore, elle perçoit des lignes sombres autour des objets qui l'entourent ; toucher ces lignes lui permet de démanteler l'objet—une capacité qui l'effraie grandement. Son ami Mikiya Kokutou sollicite l'aide de Touko Aozaki, une mage qui peut aider Shiki à comprendre ce que ses yeux—les «Mystic Eyes of Death Perception»—impliquent réellement et comment les utiliser correctement.

En février 1999, Shiki Ryougi et Mikiya Kokutou sont troublés par une série de meurtres. Ces meurtres ressemblent étrangement à une vague d'homicides survenue en 1995, année où Shiki et Mikiya se sont rencontrés pour la première fois, et ils réveillent en Shiki un désir meurtrier latent qui sommeillait en elle depuis cette époque. Alors que les soupçons se portent sur Shiki en raison de son lien avec les morts précédentes et de sa prétendue similitude avec le meurtrier, elle et Mikiya se lancent à la recherche du véritable coupable. Tandis qu'ils enquêtent séparément, Mikiya devient de plus en plus inquiet pour la sécurité de Shiki et se précipite pour retrouver le tueur, espérant protéger Shiki de ses propres pulsions intérieures. Suivant une piste fournie par son cousin, l'inspecteur de police Daisuke Akimi, Mikiya descend dans les profondeurs obscures de la ville de Mifune, où la rédemption de l'âme de Shiki dépend de sa détermination à laver son nom une fois pour toutes.

Dans une ère victorienne à vapeur, peuplée de dreadnoughts et de terreurs occultes, Zhou Mingrui renaît sous les traits de Klein Moretti. Il évolue en équilibre précaire entre lumière et ombre, pris dans les conflits des Églises en guerre. C'est l'histoire d'un potentiel illimité... et d'un péril inimaginable.

Pendant les vacances d'hiver, l'Académie pour filles Reien est en proie à une série d'incidents étranges. Azaka Kokutou, une étudiante et apprentie magicienne, est envoyée par son maître pour enquêter. Elle découvre qu'une autre magicienne vole les souvenirs des élèves via des fées — des entités qui, malgré ses capacités magiques, restent invisibles pour Azaka. En conséquence, Shiki Ryougi, une connaissance dotée d'yeux uniques capables de percevoir ce qu'Azaka ne voit pas, est également envoyée à l'académie pour l'assister. Les deux ont cependant du mal à coopérer, principalement parce qu'Azaka considère Shiki comme une rivale amoureuse. Mais alors que la situation avec les fées s'aggrave rapidement et que les couches plus profondes du mystère se révèlent, Azaka doit apprendre à travailler aux côtés de Shiki pour sauver ses camarades de classe.

La Future Foundation est en ruines après le Jeu du Meurtre Final et la révélation du véritable cerveau. Lorsqu'une personne survivante échafaude un plan désespéré pour éliminer le désespoir du monde de façon permanente, les membres restants de la Future Foundation doivent s'unir pour empêcher cette catastrophe. Heureusement, ils reçoivent l'aide d'un groupe surprenant d'alliés inattendus alors qu'ils se précipitent contre la montre pour empêcher que leur monde ne soit altéré à jamais. Dans ce chapitre conclusif de l'arc narratif de Hope's Peak dans la série Danganronpa, les participants de ce jeu de meurtre sans fin commencent à saisir la véritable signification du désespoir, de l'espoir, et du chemin vers la rédemption.

Il y a quelque temps, la gigantesque société Toue Inc. a acquis l'île japonaise de Midorijima pour construire Platinum Jail, une installation utopique et opulente. Seules les personnes les plus riches du monde ont la chance d'y résider. Les habitants originels de l'île ont été forcés de déménager dans le Vieux Quartier Résidentiel et ont été complètement abandonnés une fois Platinum Jail achevé. "Rib" et "Rhyme" sont les deux jeux les plus répandus sur l'île. Rib est un passe-temps traditionnel où des gangs s'affrontent dans des conflits territoriaux, tandis que Rhyme est un jeu high-tech où les participants combattent dans une réalité virtuelle. Pour participer à Rhyme, on doit posséder un "All-Mate" (une IA ressemblant généralement à un animal de compagnie), et le match doit être supervisé par un "Usui." Aoba Seragaki n'a aucun désir de participer à l'un ou l'autre jeu ; il souhaite simplement vivre tranquillement avec sa grand-mère et son All-Mate, Ren. Pourtant, après avoir été traîné de force dans un dangereux match de Rhyme et avoir eu vent de rumeurs concernant la disparition de joueurs de Rib, tous les espoirs d'Aoba d'une vie normale sont complètement anéantis.

Une décennie après la guerre des bulles, l'écart entre les riches et les pauvres s'est creusé à l'échelle mondiale, le Japon reflétant cette tendance. Les nantis recherchent leur propre gratification et plaisirs, transformant Tokyo en une ville façonnée par ces désirs. Saiga, ancien photoreporter de guerre, travaille désormais pour Hibara Ginza au sein du système capitaliste de Tokyo. Il s'infiltre dans le Roppongi Club, un établissement clandestin du quartier chaud de la ville, dans le but de recueillir des renseignements sur eux. Cependant, il est appréhendé et conduit devant une fille nommée Kagura, qui exécute un rituel. Sa rencontre avec Kagura déclenche son pouvoir latent : la capacité de provoquer des explosions en photographiant des objets. Déterminé à percer les secrets du Roppongi Club et de Kagura, Saiga s'engage dans une lutte solitaire.

Un véhicule conduit par Izumi Yasaka, qui avait récemment fui un établissement d'isolement et de réhabilitation pour criminels latents appelé Sanctuary, est signalé alors qu'il fonce vers le bâtiment de la Sécurité publique avant de s'y écraser. Alors que les inspecteurs Mika Shimotsuki et Akane Tsunemori s'apprêtent à interroger le suspect, ils reçoivent un ordre urgent de l'établissement exigeant le retour immédiat d'Izumi. Comprenant qu'il s'agit d'une directive du chef du Sanctuary et du conseil, les inspecteurs obéissent mais insistent pour accompagner Izumi en personne. Tsunemori prévoit de continuer son enquête au Bureau avec le reste de l'équipe. Cette affaire donne à l'inspecteur Shimotsuki l'occasion tant attendue de mener une enquête majeure en tant qu'officier principal. L'histoire suit Shimotsuki et son équipe d'Enforcers alors qu'ils explorent les vérités cachées de Sanctuary.

Kaito Daimon est un étudiant de lycée typique, à une exception près : il est un « démon » pour résoudre des énigmes. Sa brillance est telle que lorsqu'on lui demande de passer des tests « spéciaux » de son talent unique, il soupçonne immédiatement que le test lui-même est une devinette. Kaito se retrouve soudainement aspiré dans un mortel Philosopher's Puzzle créé par le sinistre groupe POG — un labyrinthe mortel de pièges en cascades, où résoudre le secret de travers signifie la mort. Heureusement, les compétences de Kaito s'avèrent à la hauteur du premier défi, tant pour lui-même que pour son ami d'enfance Nanoha, qui tombe aussi dans le piège mortel. Mais maintenant qu'il a été désigné comme Solver, il est entraîné dans une nouvelle existence où il doit voyager à travers le monde aux côtés d'autres Solvers, tentant de résoudre les dernières énigmes mortelles laissées par POG. Il y a un nouveau casse-tête à chaque coin de rue, et chaque tromperie peut mener à la mort, mais une fois une énigme présentée, on peut compter sur Kaito pour la dérouler, la démêler et la déverrouiller.

Les inspecteurs Arata Shindou et Mikhail Kei Ignatov ont découvert une dangereuse conspiration. Le Système Sybil, arbitre ultime du caractère humain au Japon, est sapé par un syndicat criminel qui accumule discrètement richesse et pouvoir dans l'ombre. Maintenant, l'agent Bifrost Kouichi Azusawa lance un assaut direct sur la Division des enquêtes criminelles (CID) en s'emparant de son quartier général et en prenant en otage l'inspecteur Shindou et tous les autres à l'intérieur. Le superviseur de l'unité 01 du CID, aux côtés de la chef Mika Shimotsuki et des anciens membres de l'unité Shinya Kougami et Nobuchika Ginoza, doit reprendre le bâtiment et sauver tous ceux qui y sont piégés. Au-delà de la crise des otages et de la demande d'Azusawa exigeant la démission de la gouverneure de Tokyo, Karina Komiya, un complot plus sombre se déroule en arrière-plan — un plan secret qui forcera l'inspecteur Shindou à affronter non seulement Azusawa, mais aussi son propre passé. Ces événements le rapprochent lentement de la révélation du mystère qui a échappé à lui et à son meilleur ami, Ignatov, pendant de nombreuses années.