Une force inconnue attaque le monde humain, utilisant des épines empoisonnées pour endormir tous les humains. Seuls Agumon, Gaomon et Lalamon sont là pour affronter cet ennemi. Avec l'aide de Rhythm, une jeune fille qu'ils ont secourue, ils apprennent que leur adversaire s'appelle Argomon. Mais que peuvent faire les trois Digimon quand ils sont incapables d'évoluer ?