Para el año 2119, la nave Green Sleeves descubrió que tres planetas habían sido atacados por X23, un planeta consciente en curso de colisión con la Tierra. Cuando el gobierno terrestre ordenó a la Green Sleeves atacar a X23, su capitán, el doctor Sugita, se negó, argumentando que la coexistencia pacífica era posible. Poco después, se perdió el contacto con la nave. Dos años después, en 2121, Susumu, el hijo del doctor Sugita, es abordado por individuos misteriosos que lo escoltan hasta Dr. Miya, una de las escasas personas partidarias de la postura de su padre, ya que la mayor parte de la sociedad veía al doctor Sugita como un traidor. Dr. Miya insta a Susumu a alistarse en White Pegasus, una unidad especializada de rescate médico equipada con un sistema Micronizer que reduce a los humanos para tratar enfermedades desde el interior. Cuando X23 finalmente entra en rango visual, los habitantes alienígenas conocidos como Hues seleccionan a la persona cercana a Susumu como su objetivo inicial. Susumu y sus camaradas de White Pegasus logran derrotar a los Hues dentro del cuerpo de dicha persona, solo para que Susumu descubra que las señales emitidas por los chips dentro de los Hues son en realidad música compuesta por él mismo y su madre, destinada como regalo para el doctor Sugita.
