Dans Romdo, une cité scellée abritant l'un des derniers refuges de l'humanité sur Terre, la survie est rendue nécessaire par une catastrophe écologique mondiale survenue des millénaires plus tôt, qui a rendu l'extérieur inhabitable. Pour soutenir la reprise, des robots humanoïdes nommés AutoReivs ont été créés pour exécuter les tâches quotidiennes. Cependant, ces machines sont touchées par une étrange affection appelée le virus Cogito, leur octroyant une conscience de soi. Re-l Mayer, petite-fille du dirigeant de Romdo, est assignée à l'enquête sur ce phénomène aux côtés de son partenaire AutoReiv, Iggy. Ce qui semblait être une investigation de routine plonge rapidement dans un labyrinthe d'intrigues lorsque Re-l affronte les transgressions les plus sombres de l'humanité. Parallèlement, dans un autre secteur de Romdo, Vincent Law, expert en AutoReivs, doit composer avec ses propres démons intérieurs alors que des incidents mystérieux se multiplient autour de lui. Re-l, Iggy, Vincent et le jeune AutoReiv Pino formeront une alliance improbable pour élucider les secrets de Romdo et découvrir la véritable nature des entités légendaires connues sous le nom de Proxies.