Les Pokémon sont des créatures étranges possédant une vaste gamme de capacités et d'apparences. De nombreuses personnes, appelées dresseurs de Pokémon, les capturent et les dressent, souvent afin de les faire combattre. Le jeune Satoshi a non seulement rêvé de devenir dresseur de Pokémon, mais aussi de « Maître Pokémon », et pour son 10e anniversaire, il a enfin l'opportunité de réaliser ce rêve. Malheureusement pour lui, les trois Pokémon disponibles pour les nouveaux dresseurs ont déjà été pris, ne laissant que Pikachu, un Pokémon de type Électrik rebelle. Cependant, cette rencontre fortuite marquera le début d'une amitié indéfectible et d'une aventure épique ! S'engageant dans un voyage pour devenir le meilleur, Satoshi et Pikachu parcourent de magnifiques et vastes régions accompagnés de leurs amis Kasumi, spécialiste du type Eau, et Takeshi, spécialiste du type Roche. Mais le danger rôde à chaque coin de rue. La célèbre Team Rocket est toujours dans les parages, tentant de voler des Pokémon puissants grâce à des plans sournois. C'est à Satoshi et à ses amis de contrer leurs efforts, tandis qu'il s'efforce également de gagner les huit Badges d'Arène Pokémon nécessaires pour défier la Ligue Pokémon et finalement revendiquer le titre de Maître Pokémon.