Sakura Kinomoto, una niña de diez años y estudiante de cuarto grado que vive en Tomoeda, tiene una vida ordinaria hasta que descubre por accidente un misterioso libro de cartas conocido como "The Clow". Al examinar su hallazgo, libera involuntariamente una ráfaga de viento mágico que dispersa las cartas por toda la ciudad.
Este suceso despierta a la Bestia del Sello, Keroberos, quien, con el apodo de "Kero", le informa a Sakura que ha liberado las místicas Cartas Clow, creadas por el hechicero Clow Reed. Dado que cada carta posee un poder inmenso y puede actuar de forma independiente, Clow las había sellado; ahora que están libres, representan una grave amenaza para el mundo, y corresponde a Sakura detenerlas.
Al nombrar a Sakura como la "Cardcaptor" y entregarle la Llave Sellada, Kero le encomienda la misión de encontrar y recuperar todas las Cartas Clow. Acompañada por su mejor amiga Tomoyo Daidouji y bajo la guía de Kero, Sakura debe equilibrar su nueva responsabilidad secreta con su vida cotidiana mientras se embarca en aventuras mágicas como Cardcaptor Sakura.