Sinopsis
Antes de la era de los humanos prehistóricos, una civilización alienígena avanzada vivió una vez en la Tierra. Descuidados con su inmenso poder, estos seres eventualmente causaron su propia extinción. Sin embargo, dejaron una advertencia para civilizaciones futuras en tablillas indestructibles: destruir cualquier remanente de la peligrosa tecnología que su especie creó. En la actualidad, la Corporación ARCAM y su fuerza paramilitar conocida como los Spriggans trabajan para sellar estas reliquias antiguas y evitar que grupos renegados abusen de su poder. Tras el reciente descubrimiento de ARCAM en las montañas de Ararat de lo que se cree es el legendario Arca de Noé, el Spriggan Yuu Ominae es enviado a investigar. Pero el sitio es atacado por el Cuerpo de Máquinas de los EE. UU.—una facción radical dentro del Departamento de Defensa comandada por el coronel MacDougall. Actuando bajo órdenes del Pentágono, MacDougall busca capturar al científico principal de ARCAM y apoderarse del artefacto. En equipo con el compañero Spriggan Jean Jacquemondo, Yuu debe detener a MacDougall y a los soldados de élite del Cuerpo de Máquinas antes de que lleguen al Arca, antes de que sea demasiado tarde.