Ordenado por seu pai, Oguna—o príncipe mais jovem de Yamato—deve assassinar Takeru Kawakami, o líder de Kumaso. Mas quando ele chega ao território de Kumaso, uma flecha perdida de Kajika, uma jovem local caçando por comida, o fere. Desejosa de se redimir, ela guia o príncipe até sua aldeia para cuidar de seu ferimento. Enquanto os dois rapidamente se apaixonam, Oguna faz uma realização horrível: Kajika é a irmã mais nova de Takeru.
Dividido entre seus sentimentos nascentes e seu dever familiar, Oguna recorre à Fênix, uma ave lendária imortal que guarda Kumaso, em busca de orientação. Forçado a escolher, o príncipe de Yamato trairá seu próprio sangue pela mulher que ama, ou cumprirá a ordem de matar o irmão de Kajika?
Baseada na lenda japonesa de Yamato Takeru, Hi no Tori: Yamato-hen narra a trágica história de um casal condenado, demonstrando como o amor genuíno pode superar o ódio e as dificuldades mesmo diante de profunda incerteza.