Sinopse
Em 1999, Amamori Hajime é um típico estudante do ensino fundamental, ocupado com os estudos e saindo com seus amigos excêntricos. Um dia, seu pai testa um equipamento que estava desenvolvendo, causando uma explosão que destrói a casa deles e deixa Hajime órfão. Ele é acolhido por seu tio, um astrônomo. No observatório de seu tio, Hajime encontra uma garota que já tinha visto antes e por quem desenvolveu uma certa paixão. Ele descobre que o nome dela é Yukino Yayoi, e que os pais dela administram uma loja de ramen na cidade. Melhor ainda, ela trabalha como assistente do tio dele — que sorte! Mas Yayoi não é o que parece. Há uma razão para ela ajudar o Amamori-san no observatório. Ela é a Millennial Queen (Sen-Nen Joou), escolhida por seu planeta natal LaMetal para vir à Terra e ajudar a se preparar para a possível destruição do planeta. Que desastre está por vir? LaMetal tem uma órbita altamente elíptica que a aproxima extremamente da Terra a cada 1000 anos. Quando se aproxima, a Terra reage, desencadeando desastres naturais generalizados. Embora ela tenha sido selecionada pensando na proteção de LaMetal, seu plano pessoal é evacuar o máximo de humanos possível para LaMetal, para que possam sobreviver se seu próprio planeta for destruído. No entanto, uma pessoa se esforça para impedi-la: o líder dos Millennial Theives. Por que ele quer impedir o plano de Yayoi? E como ele sabe sobre a Millennial Queen em primeiro lugar?