1998 年 7 月、激しい嵐の中、少女・浅上藤乃は廃墟となったバーで暴漢集団によって残忍な暴行とレイプを受ける。彼女に課された極度の身体的・性的暴力にもかかわらず、その過程で彼女は無表情で反応を示さなかった。翌日、当局は現場で切断された死体を発見し、その損傷の激しさから人間の関与は否定された。蒼崎青子の探偵事務所は新たな事件を受託し、前夜の犯人を捕縛するか排除するかを両儀式に命じた。虐殺から逃れた一人の生存者がいるという噂が広がり、殺し手は現在その証人を執拗に追っている。両儀式は危険な追走に巻き込まれ、彼女の並外れた知覚でも見えない相手と対峙することになる。

本作では

Satsujin Kousatsu (Zen) の後、Shiki Ryougi は自動車事故により 2 年間の昏睡状態に陥る。目覚めた彼女は記憶喪失と深い孤立感と格闘する。また、物体の周囲に黒い線が浮かび上がることに気づき、その線を触れると分解できる能力を持つようになる。その能力に恐怖を覚える。彼女の友人である Mikiya Kokutou は、Shiki が「死の直視」の性質を理解し、それを適切に操る方法を修得するのを助けることができる魔術師 Touko Aozaki を訪ねる。