Kiki, une sorcière de treize ans encore en formation, doit vivre seule pendant une année entière dans une ville lointaine pour devenir une sorcière pleinement qualifiée. Laissant derrière elle sa famille et ses amis, Kiki entreprend cette tradition en s'envolant vers le vaste monde sur son balai, accompagnée de son chat noir Jiji.
Après s'être installée dans la ville côtière de Koriko, Kiki a du mal à s'adapter et finit par errer dans les rues sans endroit où loger—jusqu'à ce qu'elle rencontre Osono, qui offre à Kiki le gîte et le couvert en échange de l'aide à la livraison d'articles de sa petite boulangerie. Peu après, Kiki décide de lancer son propre service de livraison à l'aide de son balai, commençant ainsi son chemin vers l'indépendance. Alors qu'elle essaie de trouver sa place parmi les habitants, Kiki leur apporte de nouvelles expériences passionnantes et finit par saisir le véritable sens de la responsabilité.
