En 1945, alors que la Seconde Guerre mondiale approche de sa fin, le Japon est ravagé par des raids aériens américains détruisant villes entières. Le Tombeau des Lucioles, ou Hotaru no Haka en japonais, relate le destin de Seita et de sa jeune sœur Setsuko, deux enfants dont l'existence est anéantie par les horreurs du conflit. Victimes de la brutalité de la guerre, ils ont perdu leur mère, leur père, leur maison et toute perspective d'avenir, subissant ainsi des conséquences tragiques. Devenus orphelins et sans abri, Seita et Setsuko sont contraints de vagabonder à travers la campagne, épuisés par la faim et la maladie. Confrontés à l'indifférence des adultes qu'ils croisent, ils réalisent que la désespérance peut transformer même les âmes les plus douces en êtres cruels. Pourtant, malgré cette adversité implacable, l'espoir juvénile des deux enfants continue de briller, les empêchant de céder immédiatement à un sort qu'ils semblent ne pouvoir éviter.