Hana, une étudiante appliquée, tombe amoureuse d'un homme mystérieux qui suit ses cours sans être officiellement inscrit. Il n'est pas tout à fait humain : durant les nuits de pleine lune, il se transforme, révélant qu'il est le dernier loup-garou survivant. Malgré cette révélation, la dévotion d'Hana reste inébranlable et ils choisissent de fonder une famille ensemble. Elle met au monde deux enfants en bonne santé, Ame, né sous la pluie, et Yuki, née sous la neige, qui héritent tous deux de la capacité de leur père à se transformer en loups. Cependant, la mort soudaine de son partenaire brise l'univers d'Hana, la laissant seule pour élever cette famille extraordinaire. La pression de devoir élever ses enfants aux penchants sauvages au cœur d'une ville surpeuplée, tout en dissimulant leur secret, finit par la convaincre de déménager à la campagne. Elle espère ainsi qu'Ame et Yuki pourront vivre libres des préjugés de la société. Wolf Children est un récit réconfortant illustrant les défis qu'affronte une mère célibataire dans un monde moderne impitoyable.