Au sein du modeste village de Tison, situé dans l'Empire Parthevia, Sinbad voit le jour, fils de Badr, un ancien soldat usé, et de sa femme au grand cœur, Esra. Sa venue projette une onde radieuse à travers le rukh, avertissant les plus puissants utilisateurs de magie que l'« Enfant du Destin » est parmi eux. Malgré les difficultés économiques et les cicatrices de la guerre qui affligent sa patrie, Sinbad vit une enfance heureuse, jusqu'à l'arrivée d'un étranger qui brise la paix du village et déclenche une tragédie.
Plusieurs années plus tard, des structures énigmatiques nommées « donjons » apparaissent à travers le monde, réputées pour abriter un pouvoir immense et d'immenses trésors. Elles attirent aventuriers et armées, mais personne n'en est jamais revenu. À quatorze ans, Sinbad est devenu un jeune homme charmant et talentueux. Guidé par les traumatismes de son enfance et les conseils de son père, il rêve d'explorer au-delà des limites de son village. Comme si le destin le poussait, il croise la route du mystérieux Yunan. Touché par l'histoire et les ambitions de Sinbad, Yunan l'oriente vers un donjon contenant le pouvoir nécessaire pour réaliser ses rêves : le « pouvoir d'un roi ».
Magi: Sinbad no Bouken retrace les premiers voyages de Sinbad alors qu'il traverse le monde, perfectionnant ses compétences et étendant son influence. En rassemblant alliés et puissance, il s'achemine vers sa destinée : devenir le Haut Roi des Sept Mers.