Des siècles après le conflit massif avec les Nokkers à Renril, le monde a changé au point d'être méconnaissable. Grâce aux efforts immortels de Fushi durant sa dormance, il a établi une société moderne où lui et tous les êtres vivants peuvent coexister pacifiquement. À son réveil après son long sommeil, Fushi cherche avec impatience à vivre tout ce que cette nouvelle ère offre et à ramener ses compagnons disparus.
En explorant, Fushi rencontre Yuuki Aoki, un collégien énergique, qui l'invite chaleureusement, lui et ses amis, chez lui. Alors que le groupe s'adapte à son nouvel environnement et apprend la vie contemporaine, Fushi fait la connaissance de Mizuha, une amie de Yuuki, qui ressemble étrangement à quelqu'un de son passé.
Mizuha s'avère être une descendante des Guardians, un groupe dévoué uniquement à la protection de Fushi. Comme ses prédécesseuses, elle développe des sentiments pour Fushi, apportant de la lumière à son existence. Pourtant, lorsque d'étranges incidents commencent à se produire autour de Mizuha chaque fois qu'elle s'approche de Fushi, il devient évident que ce monde apparemment idéal recèle des défauts cachés.