Nanami Momozono, une étudiante, fait face à une succession de malheurs : son père absent s'est endetté au point qu'ils perdent leur maison. Sans abri et découragée, elle croise la route d'un homme harcelé par un chien. Après l'avoir aidé et lui avoir raconté son désarroi, celui-ci lui offre, à son grand étonnement, son propre logement en remerciement. Toutefois, en arrivant sur place, Nanami découvre que c'est un sanctuaire en ruine. Elle tente de fuir, mais est interceptée par deux esprits du lieu et un renard familier nommé Tomoe. Ces derniers la confondent avec l'homme qu'elle a secouru, Mikage, le dieu de la terre du sanctuaire. Comprenant que Mikage l'a envoyée comme remplaçante, Tomoe décampe furieux, refusant de servir un humain.
Plutôt que de redevenir sans-logis, Nanami s'investit totalement dans ses nouvelles responsabilités divines. Pour que tout fonctionne, elle a toutefois besoin de l'aide de ce renard irascible. Lors d'une tentative maladroite pour le retrouver, elle se retrouve en mauvaise posture et finit par conclure un contrat avec lui. Désormais, le duo doit naviguer ensemble sur la voie de la divinité, déesse et familier, bien que le chemin soit semé d'embûches : un youkai souhaite la dévorer, un serpent veut l'épouser, et Nanami développe des sentiments inattendus pour son nouveau familier.