Há doze anos, uma imensa raposa demoníaca aterrorizava o mundo. Durante o ataque da besta à Vila Oculta da Folha, o Hokage, líder da aldeia e o ninja mais poderoso, sacrificou-se para selar a criatura dentro de um recém-nascido. Tal ato salvou a civilização da destruição, mas condenou a criança a uma existência de solidão.
Agora, após anos de exclusão e intimidação, Naruto Uzumaki perturba a vila com travessuras elaboradas e atos de vandalismo. Contudo, por trás dessas brincadeiras, ele treina incansavelmente para realizar seu sonho: tornar-se Hokage e conquistar o reconhecimento de quem o prejudicou ao longo da vida. Naruto é designado para o Time 7, uma equipe ninja que inclui dois de seus colegas: o prodígio Sasuke Uchiha e a inteligente Sakura Haruno.
Sob a orientação do distante Kakashi Hatake, o Time 7 executa diversas missões perigosas, forçando seus membros a crescerem em força e camaradagem, apesar de suas diferenças gritantes. Naruto se esforça para superar Sasuke na rivalidade e conquistar o afeto romântico de Sakura. Porém, à medida que o trio enfrenta perigos e mortes constantes, seus passados trágicos ameaçam separá-los.