Sinopsis
El Digital World, un reino virtual creado a partir de la red moderna, dio origen a formas de vida digital conocidas como Digital Monsters. El ordenador central Yggdrasil supervisaba las diversas regiones de este mundo. Sin embargo, Yggdrasil desarrolló el X Program, una herramienta que infunde miedo y cuyo propósito es eliminar a todos los Digimon del viejo mundo y establecer un nuevo Digital World reservado para unos pocos seleccionados. El Digital World enfrenta ahora su mayor crisis. Los X-Digimon, una nueva raza de Digital Monster, son perseguidos por los Royal Knights, quienes protegen los Digital Worlds. Yggdrasil, quien supervisa la red, pretende iniciar el Proyecto Ark, un plan para renovar los Digital Worlds y generar nuevos Digimon, pero a costa de toda otra vida digital. Este X-Digimon busca respuestas a su propia existencia mientras se esfuerza por proteger toda vida Digimon, alterando los Digital Worlds para siempre.