日本が滅亡する危機を回避した後、滝沢明は再び記憶を消して姿を消す前に「日本の王」になることを望んだ。彼は携帯電話を森美咲に預け、「旅が始まった場所で待っている」という手掛かりを残した。
それから6ヶ月後、明の行方に関する囁きが広がり、美咲は彼を見つけるためにニューヨーク市へと旅立つ。しかし、彼女の捜索は一人ではない。残されたセレクションは膨大な資源と「日本を救う」という目的を胸に、彼の足跡をたどっている。一部のセレクションは明の願いを叶えるために協力するが、他の者たちは自分たちの理想とする改革された日本を実現するために彼を排除しようと画策する。事態が緊迫し、新たな真実が明らかになる中、追跡は続く。