Adaptado do mangá shounen de Akamatsu Ken serializado em Shounen Magazine, esta história gira em torno de Negi Springfield, um mago de dez anos de Wales que deseja seguir os passos de seu pai ausente como um Magister Magi—um tipo único de mago que ajuda pessoas comuns, muitas vezes disfarçando seu trabalho como ajuda humanitária através de ONGs. Inicialmente colocado como professor de inglês em Mahora Academy em Japão, Negi é designado para uma turma de ensino fundamental composta por 31 garotas, todas mais velhas que ele. No entanto, os dias calmos de escola logo são interrompidos quando indivíduos ligados ao passado de seu pai aparecem, e Negi é compelido a forjar contratos mágicos com várias de suas alunas para lidar com as ameaças emergentes. Com o tempo, ele parte com seus companheiros para o Magic World em busca de seu pai há muito perdido. Este filme marca o final da jornada retratada nos OVAs Shiroki Tsubasa Ala Alba e Mou Hitotso no Sekai.
