Há meio século, seres aterrorizantes conhecidos como "inimigos da humanidade" apareceram em todo o mundo. Em resposta, jovens com habilidades sobrenaturais chamadas "Talentos" — como pirocinese e viagem no tempo — treinam numa academia remota em uma ilha para enfrentá-los. Nanao Nakajima se destaca de seus colegas por não ter Talento. Embora seja frequentemente intimidado por seus colegas dotados, ele continua a treinar. A situação muda quando dois novos alunos chegam: o misterioso Kyouya Onodera e Nana Hiiragi, que consegue ler mentes. Enquanto o grupo começa a se unir como nakama, desaparecimentos estranhos ocorrem, ameaçando a própria estabilidade da turma.
