A Night Raid atua como o braço secreto de assassinatos do Exército Revolucionário, uma facção criada para derrubar o Primeiro-Ministro Honest. A ganância insaciável e a sede de poder de Honest permitiram que ele explorasse o imperador criança, deixando o restante da nação a sofrer em pobreza, conflito e decadência devido à falta de uma liderança forte e benevolente. Embora os membros da Night Raid sejam assassinos experientes, eles reconhecem que tirar vidas não é um ato virtuoso e antecipam enfrentar retribuição ao removerem impiedosamente qualquer obstáculo para a revolução.
Tatsumi, um jovem ingênuo de uma aldeia distante, ingressa neste grupo de assassinos. Ele originalmente partiu em uma jornada para aliviar as dificuldades de sua cidade natal empobrecida, mas acabou convencido tanto pelos ideais quanto pela determinação da Night Raid. Akame ga Kill! narra a batalha de Tatsumi contra o Império enquanto ele encontra armas formidáveis, assassinos rivais e testes à sua ética pessoal, descobrindo, em última análise, o verdadeiro significado de ser um assassino movido por um propósito.