Kobato Hanato é uma garota gentil e genuína que tem o desejo de chegar a um certo lugar, não importa o que aconteça. Para conseguir isso, ela é designada a ajudar as pessoas quando elas estão em necessidade. Para cada coração que ela cura, uma pequena conta parecida com um doce aparece e vai para um recipiente especial. Quando o recipiente estiver cheio, seu desejo se tornará realidade.
Enquanto faz seu trabalho ao lado de seu parceiro de pelúcia, Ioryogi, Kobato conhece muitos indivíduos lidando com diferentes problemas. Desde um garoto lidando com seus pais até uma estudante do ensino médio problemática com o amor, e muitos outros entre eles, o sorriso naturalmente caloroso e o caráter extrovertido de Kobato estão preparados para melhorar o dia deles.
