Iwatobi High School Swimming Club

Um ano se passou desde a formação do Clube de Natação da Escola Iwatobi, mas nenhum novo membro entrou. Com Haruka Nanase e Makoto Tachibana agora no último ano do ensino médio, junto com seus amigos mais jovens Nagisa Hazuki e Rei Ryuugazaki, eles precisam encontrar uma maneira de recrutar novos membros. Caso contrário, o clube será dissolvido no ano seguinte por falta de integrantes. Ao mesmo tempo, a formatura se aproxima, forçando os veteranos a decidirem seus caminhos futuros. Diferente de seu amigo Rin Matsuoka, o recém-nomeado capitão do Clube de Natação da Academia Samezuka, que está firmemente determinado a se tornar um nadador profissional, Haruka e Makoto permanecem incertos sobre suas escolhas de carreira. Complicações adicionais surgem quando o velho amigo de Rin, Sousuke Yamazaki, se muda para a cidade para frequentar a Academia Samezuka. A chegada desse nadador recém-descoberto gera tensão nos relacionamentos entre ele, Rin e Haruka.

Haruka Nanase sente uma paixão profunda pela água e uma vontade inabalável de nadar. Na época do ensino fundamental, ele uniu forças com seus três amigos — Rin Matsuoka, Nagisa Hazuki e Makoto Tachibana — para vencer uma prova de revezamento. Após aquela vitória, os quatro seguiram caminhos distintos. Anos depois, eles se reencontram no ensino médio, mas Rin não demonstra interesse em retomar os laços do passado. Ele estuda em uma escola diferente e seu único objetivo é provar que é um nadador superior a Haruka. Após um encontro tenso, Haruka, Nagisa e Makoto fundam o Clube de Natação da Iwatobi High School, mas precisam de mais um membro para participar do torneio que se aproxima. Nagisa recruta Rei Ryuugazaki, ex-atleta de atletismo, para ocupar a vaga. Conforme a competição se avizinha, os quatro se aproximam através de treinos intensos, com o objetivo de vencer o evento e resolver de uma vez por todas a rivalidade entre Haruka e Rin.