A última coisa que Natsu Iwashimizu lembra sobre sua família é compartilhar seus pratos favoritos com eles. Mas quando ela acorda desse sonho, se vê a bordo de um navio naufragando, resgatada por três estranhos: Arashi Aota, uma pessoa de bom coração com pavio curto; Semimaru Asai, que gosta de zombar da personalidade tímida de Natsu; e Botan Saotome, uma mulher competente que parece entender o que está acontecendo. Após escaparem, os quatro navegam para uma ilha desabitada.
Sem que saibam, esta ilha misteriosa é na verdade o Japão. Um meteorito atingiu a Terra, exterminando a humanidade e alterando drasticamente o ambiente. Para reiniciar a população, o governo lançou o projeto "7 Seeds", dividindo as pessoas em cinco equipes — Primavera, Verão A, Verão B, Outono e Inverno — cada uma composta por sete jovens saudáveis e um guia. Natsu e seus companheiros fazem parte do Verão B, um grupo rotulado como inadaptados sociais.
Para garantir mais recursos, o grupo deve localizar um dos sete abrigos construídos pelo governo. Em um mundo hostil e desconhecido, sem entes queridos em quem confiar, os quatro precisam aprender a cooperar se quiserem sobreviver.