Lucy é uma humana única conhecida como Diclonius, caracterizada por um pequeno par de chifres e mãos telecinéticas invisíveis, o que a torna um sujeito de cruéis experimentos científicos do governo. Quando surge uma oportunidade de fugir, Lucy, endurecida por seu aprisionamento e sofrimento, desencadeia uma onda violenta de assassinatos ao se libertar de seus captores.
Durante sua fuga, ela sofre um grave ferimento na cabeça que causa uma personalidade dividida: um lado é uma criança inofensiva com habilidade limitada de fala. Nesta condição instável, ela encontra dois estudantes universitários, Kouta e sua prima Yuka, que, sem saber, acolhem uma fugitiva ferida, inconscientes de sua natureza letal. Este ato de bondade alterará suas vidas, à medida que se envolvem no mundo oculto de segredos e conspiração do governo.
One-shots incluídos:
Volume 1: MOL
Volume 2: Digitopolis
Volume 3: Memoria
Volume 5: Elfen Lied