Em 1989, Joseph Joestar viaja ao Japão a pedido de sua filha Holly para visitar seu neto Joutarou Kuujou, que está profundamente perturbado. Joutarou se trancou dentro de uma cela de prisão, com medo de que um espírito maligno o esteja possuindo e que ele possa machucar outras pessoas. Joseph, no entanto, revela a verdade: esse "espírito" é na verdade um Stand — uma manifestação física do espírito de luta de uma pessoa. Além disso, tanto Joseph quanto seu companheiro Mohammed Avdol possuem seus próprios Stands e dominam seu controle.
A visita de Joseph também traz más notícias: um antigo inimigo da família retornou dos mortos, despertando os Stands da linhagem Joestar. Mas quando um Stand se manifesta dentro de Holly, sua incapacidade de controlá-lo a deixa perigosamente doente, levando os homens à ação.
Armados com seus poderes de Stand, uma jornada que abrange o globo, do Japão ao Egito — onde seu adversário os espera — começa. Pelo caminho, eles enfrentam inúmeros usuários de Stand malévolos e ganham novos aliados, tudo enquanto lideram uma cruzada para salvar Holly e finalmente derrotar seu inimigo.