Resumo
Após a morte de Yukishiro Tomoe, Himura Kenshin tornou-se um espadachim livre dedicado a proteger os Ishin Shishi. Shishio Makoto assumiu seu papel como hitokiri das sombras, assumindo a responsabilidade pelo assassinato de Izuka, a pessoa que traíra o grupo revolucionário. O governo Meiji emergente manteve a existência de Shishio muito mais secreta do que a de Kenshin, com muitas figuras dos clãs Chōshū e Satsuma possuindo informações mínimas sobre ele. Acreditando ser prudente neutralizar Shishio antes que sua ambição de poder se tornasse muito ameaçadora, o novo regime orquestrou uma tentativa de assassinato durante a Guerra Boshin. Ele foi atingido por vários tiros, coberto de óleo e queimado vivo pelo governo liderado pelos Ishin Shishi. Embora tenha sobrevivido, o episódio deixou seu corpo inteiro severamente danificado. Na sequência, Shishio reuniu os guerreiros mais formidáveis do Japão, formando a Juppongatana, com a intenção de derrubar a administração Meiji. Shishio sonhava com um Japão sob seu comando, governado pelos princípios da seleção natural, que ele descrevia como "os fortes comem os fracos". Considerando o governo Meiji fraco demais para liderar a nação eficazmente, ele travou guerra contra eles com base nessa ideologia. Ele moldou Seta Sōjirō como um discípulo ideológico e seu braço direito, bem como o membro mais forte da Juppongatana. Shishio também planejava revitalizar a economia com petróleo assim que assumisse o controle do país.
