Houtarou Oreki, um estudante do primeiro ano do ensino médio, tem como único objetivo levar uma vida cinzenta, economizando toda a energia possível. Sua existência tranquila é perturbada quando sua irmã mais velha, Tomoe, o convence a evitar a extinção do Clube de Estudos Clássicos, que carece de membros.
Aos olhos de Oreki, o problema parecia resolvido ao visitar a sala do clube e descobrir que a colega de turma Eru Chitanda já havia se inscrito. Contudo, mesmo com sua obrigação cumprida, Oreki acaba sendo arrastado pela personalidade curiosa e vibrante de Chitanda, decidindo finalmente ingressar no grupo por conta própria.
O número de integrantes logo aumenta para quatro com a chegada dos amigos de Oreki, Satoshi Fukube e Mayaka Ibara. Guiados pela curiosidade inabalável de Chitanda, os membros do Clube de Estudos Clássicos dedicam-se a desvendar os pequenos, porém fascinantes, mistérios que povoam seu dia a dia.