O mestre de jogo Takanaka Eiji é o melhor jogador do circuito virtual, mas ele enfrenta problemas quando começa a trabalhar para a Corporação E=X. Assim como Shogo antes dele, Eiji se vê preso em um conflito mortal que envolve novamente a inteligência artificial conhecida como EVE. Mas esta é a mesma EVE? Segredos ocultos jazem sob Eden City e nas ruínas da antiga Megazone.
