Sinopse
Após o desaparecimento do sol vermelho, o Fenômeno da Ruptura atinge a cidade de Arata Kasuga, fazendo todos desaparecerem. Seu mundo não está completamente perdido, porém, pois Hijiri Kasuga, seu parente e colega de infância, lhe dá um grimório mágico que reconstrói artificialmente a realidade. Para investigar esse desastre, Lilith Asami chega e dá a Arata uma escolha: entregar o livro ou morrer. Em vez disso, Arata escolhe uma terceira opção: matricular-se na secreta Royal Biblia Academy, onde encontra outros seis usuários de magia. Juntamente com Lilith, esses seis formam a Trinity Seven, a elite da escola, cada um possuindo poderes e habilidades únicas. Movido pelo desejo de salvar Hijiri e auxiliado por seus novos aliados, Arata não deixa pedra sobre pedra em sua missão de impedir a destruição de sua cidade natal e trazer Hijiri de volta à vida.