Narumi Momose ist eine kleine, süße junge Frau mit einer Leidenschaft für Idols, Videospiele und alles, was mit Anime und Manga zu tun hat – besonders Boys-Love-Titel. Sie ist eine heimliche Otaku, genauer gesagt eine Fujoshi. Nachdem sie wegen dieser Hobbys verlassen wurde, kündigt sie ihren Job und beginnt in einer anderen Firma zu arbeiten. An ihrem neuen Arbeitsplatz sind die einzigen Kollegen, die ihr Geheimnis kennen, ihr Kindheitsfreund Hirotaka Nifuji, ein direkter Gaming-Otaku; Hanako Koyanagi, eine coole, reif wirkende Frau; und Tarou Kabakura, ein attraktiver Typ mit einem einschüchternden Gesicht, der sich ständig mit Hanako streitet.
Bei einem Drink zum Aufholen schlägt Hirotaka Narumi vor, jemanden zu finden, der ihre Interessen akzeptiert. Sie zögert – Otakus werden oft als seltsam angesehen, und die einzigen, die sie wirklich verstehen, sind andere Otakus. Aber könnte eine Beziehung zwischen zwei Otakus tatsächlich funktionieren?
Wotaku ni Koi wa Muzukashii folgt Narumi und Hirotaka, während sie anfangen, sich zu daten. Es ist eine unbeschwerte Geschichte über Menschen, die versuchen, Arbeit, Romantik und ihre Hobbys unter einen Hut zu bringen.