闇と戦い、弱者を守るという使命のもと、サイボーグ009チームは科学者のギルモア博士と緊密に協力する。特殊なサイバーネットの強化を施された9体のサイボーグは、ロボットカニ、異星人、他のサイボーグなど、多種多様な敵と対峙する。各メンバーは、チームが邪悪な勢力を打ち負かすための独自の能力を備えている。リーダーである009、通称ハリケーン・ジョーは、元レーシングドライバーであり、超人的な力、弾丸に耐える皮膚、驚異的な速度で移動する能力で仲間たちを導く。仲間たちと共に、人類が悪意ある存在の支配に落ちるのを防ぐため戦う。009チームは数多くの敵と対峙し、地球とその人々に対する無数の脅威を阻止する。障害はあれど、正義は常に勝利する。