永続的に暗闇に包まれた地下都市ルクスでは、住民が絶え間ない恐怖に怯え、ライバルとなる犯罪組織の抑圧的な支配下にある。地上の世界から分断されたこれらの集団は、ルクスの存続を支える鉱物「ラフィア」の採掘を通じてのみ接触している。
この独特な物質はルクスにのみ存在し、免疫拒絶反応を引き起こさずに身体の一部を義肢で置き換えることができる「テクノライズ」手術に不可欠である。謎めいた組織「クラス」はこれらの移植を研究し、ラフィアの生産を支配している。そして、テクノライズされた脚を持ち、ルクスの「声」を聞くとされる圭吾・大西率いる「オルガノ」に行政権限が与えられている。
ルクスの脆い権力バランスが、謎めいた異邦人・佳穂・吉井によって引き起こされた一連の犯罪によって崩れ去る。これによりギャング間の対立が火花を散らし、新たな人物が姿を現す。オルガノによって半身不随にされ、エリコ・カマタ(通称「ドク」)によってテクノライズされた義肢を装着した元ボクサーのイチセと、予知能力を持つ若き花屋のランである。ルクスが混沌へと堕ちる中、イチセとランは都市が直面した最も深刻な危機の中心に立たされることになる。