第一次世界大戦のパイロットだったマルコ・パゴットが呪いによって豚に変えられた後、彼はその異名「紅の豚(ポルコ・ロッソ)」を名乗り、アドリア海で空賊を追い詰める有名人となった。孤立した島で暮らすポルコは、主に賞金稼ぎや、ホテル・アドリアーノを営む魅力的な歌手ジナを訪れるために外へ出る。
故障したエンジンを修理するため出かけた際、野心に満ちた若きアメリカ人パイロット、ドナルド・カーティスに待ち伏せされる。名声を求めたドナルドは、飛ぶ豚のキャリアを終わらせると豪語した。ジナを失望させないため、ポルコは著名な航空機メーカー、ピッコロ・エス・ピー・エー(Piccolo S.P.A.)へ逃亡し、戦闘機の改修とアップグレードのための多額の融資を確保する。驚くべきことに、同社の主任技術者は、17歳の航空天才を志すフィオ・ピッコロだった。フィオによる改修により、ポルコはドナルドと対峙し、自身の評判を回復する準備が整った。