大学受験に失敗した十八歳の水柿ツカサは、コネを使ってシオン人工知能株式会社の職を得る。同社は、人間とほぼ見分けがつかない高度なアンドロイド「ギフティア」を生産しているが、それらには厳格な動作上限時間である八万千九百二十時間(約九年四ヶ月)が設定されている。ツカサは、寿命が近づいたギフティアを回収し、記憶喪失や潜在的な危険を防ぐための部署「ターミナルサービス1」に配属される。着任早々、彼は熟練チームメンバーであり、驚くほど美しいギフティアであるアイラと組むことになる。繊細で控えめな性格ながら、彼女は回収業務において卓越した能力を発揮する。二人の時間が避けられない終わりに近づく中、ツカサは、何も永遠には続かないという厳しい現実を受け入れつつ、アイラに対する深まる想いに苦悩する。