Une menace mortelle plane sur Tokyo : des goules, des créatures anthropophages indiscernables des humains, se dissimulent au sein de la population. Ken Kaneki, un étudiant introverti accaparé par ses lectures, ignore volontairement les rapports sur cette crise grandissante. Sa solitude prend fin lorsqu'une belle femme, Rize Kamishiro, l'invite audacieusement à un rendez-vous.
Pendant le trajet pour raccompagner Rize chez elle, Kaneki découvre qu'elle n'est pas la personne bienveillante qu'elle laissait supposer, mais qu'elle l'a attiré avec de mauvaises intentions. Après une bagarre violente, il se réveille à l'hôpital, apprenant que sa vie a été sauvée grâce à la transplantation des organes de Rize, désormais décédée, dans son corps.
Le corps de Kaneki commence alors à subir des transformations terrifiantes, le faisant basculer vers un état hybride entre humain et goule. Alors qu'il s'engage sur cette nouvelle voie sombre, Kaneki s'accroche désespérément à son humanité au milieu d'une guerre sanglante qui s'intensifie entre ces nouveaux monstres de la société et les agents gouvernementaux chargés de les traquer.