Des milliers de joueurs étaient piégés dans le jeu de réalité virtuelle The New Gate, et le joueur d'élite Shinya Kiritani résolut de terminer le jeu pour que tout le monde puisse enfin rentrer chez soi. Après avoir vaincu le boss final en solo, Shinya est transporté dans un nouveau monde qui ressemble étrangement à celui dont il vient de s'échapper.
Shinya réalise que tant que son menu de jeu et ses compétences restent inchangés, il n'a aucun moyen de quitter ce monde étrangement familier. En cherchant un moyen de sortir de cette nouvelle prison dimensionnelle, Shinya rencontre Tiera Lucent, une réceptionniste d'hôtel qui est la protégée de Schnee Raizar, un ancien membre de l'équipe de Shinya. Cette lueur d'espoir pousse Shinya à retrouver Schnee et à découvrir la vérité derrière The New Gate.
