Pour le lycéen Shouichi Kamita, les inquiétudes concernant les examens d'entrée à l'université et ce qui l'attend sont des préoccupations typiques. Pourtant, c'est aussi à ce stade de la vie qu'une émotion déroutante, qui trouble les gens de tout âge, peut commencer à occuper ses pensées—l'amour romantique.
À ce moment de son adolescence, Shouichi rencontre trois filles avec lesquelles il peut envisager un avenir : la toujours joyeuse Hikari Tsuneki, qui le taquine sans pitié mais révèle un côté doux ; la joueuse compétitive Tooru Miyamae, qui a du mal à s'exprimer face aux autres ; et l'amie d'enfance de Shouichi, Kyouko Touno, une enthousiaste parfois immature de shoujo manga. Seiren retrace les liens de Shouichi avec ces trois filles à travers trois intrigues distinctes, alors que leurs sentiments évoluent d'une attirance mutuelle vers quelque chose de plus profond.
