Dans sa jeunesse, le jeune élève Shouya Ishida combattait l'ennui en agissant avec cruauté. Lorsque la sourde Shouko Nishimiya rejoint sa classe, Shouya et ses camarades la tourmentent sans réfléchir pour s'amuser. Après que sa mère a signalé le harcèlement à l'école, Shouya est isolé et tenu pour responsable de tout. Shouko est transférée ailleurs, et Shouya est laissé à la merci de ses pairs, qui le rejettent impitoyablement tout au long de l'école primaire et du collège, tandis que les professeurs détournent le regard.
Maintenant en troisième année de lycée, Shouya reste hanté par ses méfaits d'enfance. Regrettant sincèrement ses actions passées, il s'engage sur une voie de rédemption : retrouver Shouko et obtenir son pardon.
Koe no Katachi raconte l'histoire touchante des retrouvailles de Shouya avec Shouko et de ses efforts sincères pour se racheter, même si les ombres de son passé continuent de le poursuivre.