Rika Furude et ses amis résident dans le hameau de montagne isolé de Hinamizawa. En juin 1983, ils accueillent l'élève transféré Keiichi Maebara, qui devient le seul garçon du groupe. Ils passent leurs après-midi à jouer et à profiter de chaque journée. Pourtant, sous cette apparence ordinaire, Keiichi perçoit des comportements étranges de la part de ses camarades, qui semblent dissimuler les sombres mystères du village.
De loin, une personne observe ces événements troublants et se rappelle chaque occurrence où ce récit, ou des récits similaires, a eu lieu. Forte de cette mémoire, cette personne décide de réparer ces réalités fracturées. Mais lorsque certains facteurs changent, cette personne se trouve confrontée à une vérité terrifiante : elle ignore complètement ce qui va se passer ensuite et comment empêcher la catastrophe imminente.
