À première vue, le lycée Koudo Ikusei Senior High School apparaît comme un établissement idéal, offrant à ses élèves une liberté exceptionnelle et jouissant d'une renommée prestigieuse à travers le Japon. Cependant, la réalité est bien moins idyllique. Les quatre classes, de A à D, sont hiérarchisées selon le mérite, seuls les élèves des classes les plus élevées accédant à des privilèges exclusifs.
Kiyotaka Ayanokouji est affecté à la classe D, le groupe réservé aux pires élèves de l'école. C'est là qu'il croise Suzune Horikita, une élève antipathique convaincue d'avoir été placée par erreur dans cette classe et déterminée à atteindre la classe A, ainsi que Kikyou Kushida, l'idole sympathique du groupe dont l'objectif est de se lier d'amitié avec le plus grand nombre.
Bien que les affectations initiales soient figées, les classements peuvent évoluer : les élèves des classes inférieures peuvent gravir les échelons en surpassant ceux des classes supérieures. Par ailleurs, la classe D ne subit aucune restriction quant aux méthodes employées pour progresser. Dans cet environnement scolaire impitoyable, parviendront-ils à surmonter les obstacles et à atteindre le sommet ?