Dans le quartier d'Asakusa à Tokyo, il y a une demeure tranquille appelée Ayakashi-sou. Bien que spacieuse, elle n'abrite qu'une seule jeune fille de seize ans. Cependant, la maison tire son nom des ayakashi — les esprits et fantômes japonais qui y habitent. Y vivent Kuuko, une renarde espiègle qui adore les farces, et Yukime, une douce femme des neiges. La zashikiwarashi au caractère enfantin, Kii, veille sur les lieux. Bientôt, ils sont rejoints par une chatte youkai nouvellement créée, Nene, qui n'a nul autre endroit où aller.
La propriétaire de l'immeuble est Mahoro Miyatsuka, qui l'a hérité de sa défunte grand-mère parce qu'elle peut voir et interagir avec les esprits. Bien que cette capacité lui permette de se connecter aux ayakashi, l'habitude de Mahoro de parler à des gens invisibles a poussé ses camarades de classe à l'éviter. Malgré tout, elle est heureuse de prendre soin de ses compagnons fantomatiques alors qu'ils passent leurs journées à regarder des feux d'artifice, jouer à des jeux et vivre un jour à la fois.
