L'humanité a voyagé parmi les étoiles, découvrant les vestiges de civilisations extraterrestres disparues depuis longtemps. Sur la planète Solo, ces découvertes archéologiques mènent à un contact surprenant avec une race extraterrestre bien vivante : le clan Buff. Quand Karala Ajiba, fille du commandant militaire Buff, arrive à la surface de Solo, son peuple lance une attaque sauvage contre la colonie pour la récupérer. Pour survivre, Cosmo Yuki, Kasha Imhof et Bes Jordan montent à bord de trois véhicules qui fusionnent en un mécha humanoïde géant, l'Ideon. Après la dévastation de la colonie de Solo, les survivants s'enfuient à bord du vaisseau Solo nouvellement découvert, espérant distancer leurs poursuivants et trouver la paix. Cependant, le clan Buff inflexible continue sa chasse implacable, refusant de les laisser partir.