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Le scientifique inventif Rintarou Okabe possède une soif insatiable de découvertes scientifiques. Avec son amie écervelée mais au grand cœur Mayuri Shiina et son colocataire Itaru Hashida, Okabe fonde le Future Gadget Laboratory, visant à créer des avancées technologiques qui défient la compréhension humaine. Malgré des ambitions élevées, la seule invention notable de l'équipe jusqu'à présent est un micro-ondes doté de l'étrange capacité de transformer des bananes en une boue verte. Lorsqu'Okabe assiste à une conférence sur le voyage dans le temps, il rencontre une série d'événements étranges qui suggèrent que le gadget « Phone Microwave » cache bien plus de potentiel qu'on ne le pensait initialement. Capable d'envoyer des messages texte dans le passé via le micro-ondes, Okabe explore plus en profondeur cette machine à voyager dans le temps de fortune, attirant l'attention hostile de l'organisation obscure SERN. Cette découverte révolutionnaire plonge Okabe et ses amis dans un péril constant. Alors qu'il lutte pour réparer les dégâts que son invention a infligés à la chronologie, Okabe se bat non seulement pour protéger ceux qui lui sont chers, mais aussi pour préserver sa propre santé mentale qui s'effiloche.

En l'an 2010, le Saint Empire de Britannia poursuit son expansion en tant que puissance militaire dominante, commençant par la conquête du Japon. Après sa défaite rapide, le Japon est rebaptisé Zone 11, et son peuple oppose une résistance significative contre les oppresseurs pour tenter de gagner son indépendance. Lelouch Lamperouge, un étudiant britannien, est pris dans un échange de tirs entre les forces britanniennes et les combattants rebelles de la Zone 11. Il s'échappe grâce à l'intervention opportune d'une mystérieuse fille nommée C.C., qui lui accorde le Geass, le « Pouvoir des Rois ». Réalisant l'immense potentiel de ce « pouvoir d'obéissance absolue », Lelouch s'engage sur une voie dangereuse en tant que justicier masqué Zero, menant une campagne impitoyable contre Britannia pour assouvir sa vengeance finale.

En l'an 2071, l'humanité a colonisé la galaxie, mais des problèmes typiquement terrestres tels que les meurtres, l'abus de drogues et les vols persistent. Par conséquent, un nombre croissant de chasseurs de primes endurcis traquent les hors-la-loi intergalactiques. Spike Spiegel et Jet Black voyagent à travers l'espace, pourchassant des criminels afin de gagner leur vie modestement. Sous l'apparence idiote et détachée de Spike se cache le poids d'un passé violent. Jet fait face à ses propres souvenirs douloureux tout en prenant soin de Spike et de leur vaisseau, le Bebop. Ils sont ensuite rejoints par l'attirante escroc Faye Valentine, l'enfant excentrique Edward Wong Hau Pepelu Tivrusky IV, et Ein, un corgi gallois biogénétique. Alors que l'équipage du Bebop tisse des liens et capture une grande diversité de criminels, leurs vies sont ébranlées par une menace venue du passé de Spike. Avec le plan insensé d'un rival qui se déploie, Spike se retrouve face à un choix entre sa vie avec sa nouvelle famille ou la vengeance de ses vieilles rancunes.

Des extraterrestres parasites descendent soudainement sur Terre, infiltrant l'humanité en s'enfonçant dans le cerveau de cibles vulnérables. Ces créatures insatiables prennent le contrôle total de leurs hôtes et peuvent se métamorphoser en diverses formes pour chasser des proies sans méfiance. Shinichi Izumi, un lycéen de seize ans, est attaqué par l'un de ces parasites, mais celui-ci ne parvient pas à prendre le contrôle de son cerveau et finit dans sa main droite à la place. Incapable de se déplacer jusqu'à l'endroit prévu, le parasite, nommé Migi, doit compter sur Shinichi pour survivre. Cela force le duo à une coexistence précaire alors qu'ils se défendent contre des parasites hostiles déterminés à éliminer cette nouvelle menace pour leur espèce.

Quinze ans après le catastrophique Second Impact, l'humanité est assiégée par des êtres angéliques colossaux appelés Anges, qui attaquent Tokyo-3 les uns après les autres. Malgré le déploiement de leurs armes et stratégies militaires les plus avancées, l'humanité est impuissante face à eux. Le seul espoir repose sur la NERV, une organisation secrète dirigée par le froid Gendou Ikari. La NERV opère de gigantesques robots humanoïdes appelés Evangelions, équipés d'armements de pointe et de barrières protectrices nommées Champs de Terreur Absolus, pour combattre les Anges. Après des années d'abandon par son père, Shinji Ikari, 14 ans, revient à Tokyo-3. Il lutte constamment contre un traumatisme profond lié à la perte de sa mère et à la négligence émotionnelle de son père. Craignant de créer des liens, la vie de Shinji change lorsqu'il rencontre Misato Katsuragi, 29 ans, une officier supérieure de la NERV qui lui offre la chaleur maternelle qu'il n'a jamais connue. Une attaque soudaine d'un Ange force Shinji à agir, révélant la véritable raison de sa convocation par Gendou : Shinji est le seul capable de piloter efficacement l'Evangelion Unité-01, un nouveau robot qui se synchronise avec ses signaux biologiques. Malgré les tourments psychologiques intenses que lui cause le pilotage d'un Evangelion, Shinji défend Tokyo-3 contre la menace angélique, ignorant les sombres machinations de son père.

Une année s'est écoulée depuis l'échec de la Rébellion Noire contre le Saint Empire de Britannia, au cours de laquelle le justicier masqué Zero a disparu. Privés de leur chef révolutionnaire, le groupe de résistance de la Zone 11, les Chevaliers Noirs, sont trop affaiblis pour résister à la brutalité accrue que Britannia inflige aux Eleven afin d'éteindre tout espoir de soulèvements futurs. Pendant ce temps, Lelouch Lamperouge, ayant perdu tous les souvenirs de sa double vie, vit paisiblement en tant qu'étudiant au lycée d'Ashford Academy avec ses amis. Son ancienne partenaire C.C., incapable d'accepter ce changement, prend sur elle de lui rappeler son objectif passé, espérant que le cerveau Zero renaîtra pour terminer ce qu'il a commencé.

Dans un futur lointain où les immenses Klaxosaurs ont poussé l'humanité au bord de l'extinction, les survivants se réfugient dans des cités fortifiées appelées Plantations. Là, des enfants sont élevés pour piloter des méchas géants nommés FranXX en paires garçon-fille, car ce sont les seules armes capables de combattre les monstres. Tenus à l'écart, ces jeunes ne savent rien du monde extérieur et ne peuvent justifier leur existence qu'en défendant leur espèce. Hiro, un garçon destiné à devenir pilote, a perdu sa détermination et son assurance après avoir échoué à un test d'aptitude. Il sèche la cérémonie de remise des diplômes de sa classe et se cache près d'un lac forestier, où il rencontre une mystérieuse fille cornue qui se fait appeler Zero Two. Son code la désigne comme la tristement célèbre « Tueuse de partenaires », une pilote qui a conduit tous ses partenaires précédents à la mort. Avant que Hiro ne puisse pleinement comprendre cette rencontre, un Klaxosaur attaque la Plantation. Zero Two combat la créature dans son FranXX mais subit de lourds dégâts et s'écrase près de Hiro. Constatant que son précédent partenaire est mort, elle invite Hiro à prendre les commandes. Ensemble, ils vainquent le Klaxosaur avec facilité. Désormais lié à une nouvelle partenaire, Hiro entrevoit une chance de rédemption, mais il doit se demander quel prix cette seconde chance exigera.

Simon et Kamina grandissent dans un profond village souterrain, caché du monde légendaire de la surface. Kamina est un rebelle fougueux et impulsif, déterminé à se forger sa propre légende, tandis que Simon est un garçon timide sans véritables rêves. Un jour, en creusant dans la terre, Simon découvre un objet étrange qui s'avère être la clé d'activation d'une ancienne machine de guerre, que les deux nomment Lagann. Grâce à leur nouvelle arme, Simon et Kamina repoussent une attaque soudaine venue de la surface, aidés par Yoko Littner – une rousse féroce armée d'un gros fusil qui parcourt le monde d'en haut. Après le combat, le ciel devient visible pour la première fois, inspirant Simon et Kamina à entreprendre un voyage avec Yoko à travers la surface aride. Ils rejoignent bientôt la lutte contre les "Beastmen", des monstres humanoïdes qui tourmentent ce qu'il reste de l'humanité à l'aide de puissants mechas appelés "Gunmen". Malgré les difficultés et les pertes, le trio combat courageusement ces ennemis aux côtés d'autres survivants pour reconquérir la surface, découvrant peu à peu un mystère qui s'étend à toute la galaxie.

La justice et son application ont évolué. Au 22e siècle, le Japon fonctionne sous le système Sibyl, une méthode objective pour évaluer le niveau de menace de chaque citoyen en analysant son état mental à la recherche d'intentions criminelles, connu sous le nom de Psycho-Pass. Les Inspecteurs font respecter la loi en neutralisant – souvent mortellement – toute personne montrant la moindre mauvaise intention ; à leurs côtés travaillent les Enforcers, des citoyens devenus criminels latents, à qui l'on accorde une liberté limitée en échange de l'exécution des tâches sombres des Inspecteurs. C'est dans ce monde qu'entre Akane Tsunemori, une jeune femme animée d'un désir sincère de défendre la justice. Mais alors qu'elle collabore avec l'Enforcer Shinya Kougami, qui a déjà une longue expérience, elle découvre bientôt que les verdicts du système Sibyl ne sont pas aussi parfaits que ses collègues Inspecteurs le croient. Tout ce en quoi elle avait confiance étant bouleversé, Akane se débat avec la nature de la vraie justice et la question de savoir si elle peut être atteinte par un système qui est peut-être déjà défaillant.

Au plus profond de la terre se trouve un vaste gouffre connu sous le nom de l'Abysse, regorgeant de créatures étranges et de reliques anciennes d'époques révolues. Ses origines et ce qui existe à son point le plus profond restent des mystères non résolus que d'innombrables explorateurs, appelés Plongeurs, ont risqué leur vie pour découvrir en descendant dans ses ténèbres les plus reculées. Les Plongeurs les plus talentueux et courageux — les Sifflets Blancs — sont célébrés comme des légendes parmi ceux qui restent à la surface. Riko, la fille de la disparue Sifflet Blanc Lyza l'Annihilatrice, rêve de suivre les traces de sa mère et d'explorer les profondeurs les plus lointaines de l'Abysse. Cependant, elle n'est qu'une novice Sifflet Rouge, autorisée à s'aventurer pas plus loin que la couche la plus haute. Un jour, elle tombe sur un mystérieux robot qui ressemble à un garçon ordinaire. Elle le nomme Reg, et il n'a aucun souvenir de ce qui s'est passé avant sa découverte. Convaincue que la technologie derrière Reg doit provenir des profondeurs de l'Abysse, tous deux décident de s'aventurer dans le gouffre — Reg pour retrouver ses souvenirs perdus, et Riko pour voir le fond du grand puits de ses propres yeux. Pourtant, ils restent inconscients des cruelles vérités qui les attendent dans la véritable réalité de l'Abysse.

La combustion humaine spontanée est une affliction chaotique qui tourmente l'humanité depuis des années, transformant aléatoirement des gens normaux en êtres flamboyants et agressifs appelés Infernaux. Alors que les Infernaux représentent les cas de première génération de la Combustion humaine, les individus de deuxième et troisième générations sont connus sous le nom de pyrokinétiques — des humains capables de manipuler et contrôler leurs flammes sans perdre leur humanité. Pour lutter contre la menace des Infernaux et découvrir leur origine, les Forces armées de Tokyo, l'Agence de défense incendie et la Sainte Église de Sol ont créé leur solution : la Force Spéciale de Pompiers. Le pyrokinétique de troisième génération Shinra Kusakabe, surnommé Pas du Diable pour son talent explosif à enflammer ses pieds à volonté, rejoint la dynamique 8e Compagnie de la Force Spéciale de Pompiers. Fidèle à la mission de l'unité d'éteindre les Infernaux enragés et d'apaiser leurs esprits, Shinra est déterminé à devenir un héros qui sauve ceux qui sont en danger à cause de la terreur des flammes. Mais ce n'est pas l'aventure héroïque que Shinra imaginait. La Force Spéciale de Pompiers est un fouillis divisé de brigades querelleuses, des apparitions anormales d'Infernaux se multiplient dans tout Tokyo, et un groupe mystérieux prétend avoir des connaissances sur l'étrange incendie qui a tué la famille de Shinra il y a 12 ans. Confronté à de nombreux obstacles à l'intérieur et à l'extérieur des pompiers, Shinra se bat pour révéler la vérité derrière les mystères ardents qui l'ont maintenu dans l'ombre.

Ganta Igarashi pensait se rendre en voyage scolaire ordinaire à Deadman Wonderland, un parc à thème bâti autour d'une prison où les condamnés exécutent des numéros à couper le souffle pour des foules payantes. Mais tout change quand un mystérieux personnage en rouge apparaît et assassine tous les élèves de sa classe. Faussement accusé du crime et condamné à mort, Ganta se retrouve enfermé dans la prison même qu'il était venu voir. Son cauchemar ne fait que commencer alors qu'il est plongé dans un monde de détenus brutaux et de pouvoirs étranges. Équipé d'un collier qui le tuera à moins qu'il ne gagne les épreuves mortelles de la prison, Ganta doit survivre dans un endroit dangereux où il est difficile de savoir à qui faire confiance. Il lutte pour rester en vie tout en cherchant l'Homme en rouge pour blanchir son nom à l'intérieur de Deadman Wonderland.

Le 24 décembre 2029 — une date qui sera connue sous le nom de « Noël perdu » —, le virus de l’Apocalypse balaye le Japon, provoquant une vague de morts et plongeant la nation entière dans le chaos le plus total. Pour rétablir l’ordre, les Nations unies envoient le GHQ gérer la crise en contenant l’épidémie, mais ce faisant, elles privent le Japon de toute son indépendance politique. Une décennie plus tard, le pays reste sous l’autorité du GHQ, incapable d’échapper à sa dure tutelle. Mécontent de la situation du pays, un groupe rebelle baptisé « Funeral Parlor » cherche à libérer le Japon du contrôle du GHQ. Sous le commandement du charismatique Gai Tsutsugami, le groupe prévoit de voler une fiole contenant le « Void Genome » pour faire avancer sa cause. La fiole atterrit entre les mains de la chanteuse internet Inori Yuzuriha, qui est alors prise en chasse par les forces anti-corps du GHQ. Sans issue, elle se réfugie dans un entrepôt, où elle rencontre Shuu Ouma — un lycéen maladroit qui est un fervent fan de sa musique. Shuu est entraîné dans la tourmente dès l’instant où il vient en aide à Inori, et le Void Genome se brise dans sa main, lui conférant le « Power of the Kings ». Alors qu’il peine à maîtriser cette redoutable nouvelle capacité, Shuu doit désormais se battre pour libérer le Japon de ses oppresseurs cruels.

Edo prospérait autrefois grâce à l'esprit et à l'ambition des samouraïs de tout le pays. Mais après que le Japon féodal a capitulé devant de puissants envahisseurs aliens appelés les « Amanto », ces rêves semblent hors de portée. Le shogunat autrefois influent a été rebâti en un gouvernement fantoche, et une nouvelle loi interdit rapidement toutes les épées en public. Entrez Gintoki Sakata, un homme excentrique aux cheveux argentés qui porte toujours une épée en bois et vit toujours en samouraï malgré l'interdiction. En tant que fondateur de Yorozuya, une petite entreprise qui accepte des petits boulots, Gintoki part souvent aider les autres, bien que de manière généralement bizarre et imprévisible. Avec l'aide de Shinpachi Shimura, un garçon portant des lunettes censé suivre la voie du samouraï ; Kagura, une fille garçonne à la force surhumaine et à l'appétit insatiable ; et Sadaharu, leur énorme chien de compagnie qui adore mordre la tête des gens, la Yorozuya rencontre tout, de la royauté extraterrestre aux affrontements avec des gangs locaux dans le monde en constante évolution d'Edo.

Au début du XXIe siècle, la magie est passée du statut de légende ancienne à celui de domaine d'étude raffiné enseigné comme une discipline formelle. La First High School, l'institution la plus prestigieuse pour les utilisateurs de magie, trie les élèves en fonction de leurs résultats aux examens d'entrée : ceux qui obtiennent des notes élevées sont désignés « Blooms » dans le First Course, tandis que ceux qui ont des résultats inférieurs sont étiquetés « Weeds » dans le Second Course. L'histoire de Mahouka Koukou no Rettousei suit les frère et sœur Tatsuya et Miyuki Shiba. Les capacités exceptionnelles de Miyuki lui valent une place dans le First Course, tandis que Tatsuya est affecté au Second Course en raison de ses faibles résultats aux tests pratiques. Néanmoins, bien qu'il soit considéré comme un « Weed », Tatsuya possède de vastes connaissances techniques, une prouesse au combat exceptionnelle et des pouvoirs magiques uniques, ce qui fait de lui l'irrégulier d'une école secondaire de magie.

Il y a trente ans, un cataclysmique séisme spatial a ravagé la masse continentale eurasienne, tuant plus de 150 millions de personnes dans un phénomène d'origine inconnue. Depuis, le monde subit des perturbations sismiques périodiques, bien que plus légères. Shidou Itsuka, un lycéen typique vivant avec sa jeune sœur Kotori, voit sa vie bouleversée lorsqu'un séisme spatial massif menace la ville de Tengu. Se précipitant pour sauver Kotori, Shidou est entraîné à l'épicentre et rencontre une mystérieuse fille connue sous le nom de Spirit, une entité surnaturelle capable de déclencher ces catastrophes. Pris entre le Spirit et l'Anti-Spirit Team, un groupe militariste voué à leur destruction, Shidou rencontre également Ratatoskr, une faction dédiée à la protection des Spirits. Remarquablement, cette organisation est dirigée par sa propre sœur, Kotori. Elle recrute Shidou pour aider à neutraliser la menace par une méthode particulière : il doit faire tomber les Spirits amoureux de lui. Alors que la survie de la planète est en jeu, Shidou doit compter sur sa prouesse romantique pour charmer chaque Spirit et sceller leur pouvoir.

Dans la métropole futuriste californienne de Night City, les rêves sont voués à périr. David Martinez, un adolescent vivant dans les quartiers pauvres, s'efforce de réaliser l'ambition de toute une vie de sa mère : qu'il gravit les échelons d'Arasaka, la première société de sécurité du monde. Pour y parvenir, il fréquente la prestigieuse Académie Arasaka tandis que sa mère travaille sans relâche pour subvenir aux besoins de leur famille. Lorsqu'une confrontation avec un gang de rue ruine sa vie, David découvre l'implante cybernétique Sandevistan, une prothèse qui confère une vitesse surhumaine à son utilisateur. Poussé par la rage, David s'implante l'appareil dans le dos et l'utilise pour se venger de l'un de ses agresseurs. Cet acte entraîne son expulsion de l'académie, anéantissant tout espoir de rendre sa mère fière. Après avoir observé les nouvelles capacités de David, Lucyna « Lucy » Kushinada, qui est une séduisante voleuse de données, lui propose un partenariat, lui offrant une voie vers le salut. Cependant, fréquenter Lucy expose David au monde des Edgerunners – des criminels cyborgs prêts à violer toute loi pour le profit. Les Edgerunners meurent souvent, soit à cause de leurs implants cybernétiques, soit par effondrement mental, mais dans sa lutte pour survivre au sein d'un système corrompu, David est prêt à tout risquer.

Suite à la mort d’un ami proche, Shinji Ikari tombe dans un coma émotionnel. Parce que son fils est mentalement incapable de piloter l’Evangelion Unit-01, la NERV de Gendou Ikari s’engage dans une course contre l’organisation secrète SEELE pour exécuter en premier leurs plans ultimes respectifs. SEELE a l’intention de créer une entité divine en fusionnant ses âmes dans une unité Evangelion, tandis que Gendou cherche à ramener toute l’humanité à une forme primordiale unique pour pouvoir retrouver Yui, sa défunte épouse. SEELE déploie son armée pour lancer un assaut mortel sur le quartier général de la NERV. Alors que les troupes de SEELE massacrent les scientifiques et le personnel de sécurité de la NERV, Asuka Langley Souryuu pilote l’Evangelion Unit-02 dans une ultime et désespérée défense contre les armes les plus puissantes de SEELE. Le conflit s’intensifie tandis qu’un Shinji abattu se cache au plus profond de la NERV. Avec le destin du monde entre les mains de Shinji, le capitaine Misato Katsuragi recherche l’adolescent tandis que la société s’effondre autour d’eux.

Après avoir échoué aux examens d'entrée à l'université, Tsukasa Mizugaki, âgé de dix-huit ans, obtient un emploi à la Sion Artificial Intelligence Corporation grâce à ses relations personnelles. Cette organisation fabrique des Giftias, des androïdes sophistiqués presque impossibles à distinguer des humains, bien qu'ils possèdent une durée de vie limitée de 81 920 heures, soit environ neuf ans et quatre mois. Tsukasa est affecté au Terminal Service One, une unité chargée de récupérer les Giftias qui ont atteint leur date d'expiration afin d'éviter qu'ils ne perdent leurs souvenirs et ne deviennent hostiles. Peu après son arrivée, il est jumelé avec Isla, une Giftia d'une beauté époustouflante et une vétérane du Terminal Service. Malgré sa petite taille et son air calme, elle est considérée comme la meilleure experte en récupération de Giftias. Alors que leur temps ensemble touche à sa fin, Tsukasa doit faire face à son affection grandissante pour Isla, réalisant que, quoi qu'on souhaite, rien ne dure éternellement.

La plupart des gens rejettent l'existence des extraterrestres, des voyageurs temporels et des médiums, et l'ordinaire lycéen Kyon ne fait pas exception. Sa perspective banale est brisée le premier jour d'école lorsqu'il rencontre Haruhi Suzumiya, une fille déterminée à bouleverser sa réalité. Pendant les présentations en classe, Haruhi déclare haut et fort son mépris pour les individus ordinaires et son désir de rencontrer le surnaturel. Découvrant que l'école ne possède pas de club dédié aux phénomènes paranormaux, elle forme impulsivement la Brigade qui répand la joie dans le monde entier avec Haruhi Suzumiya, communément appelée la SOS Brigade. Haruhi recrute ensuite Kyon ainsi que trois autres étudiants : la stoïque Yuki Nagato, férue de lecture ; la timide aînée Mikuru Asahina ; et le toujours joyeux Itsuki Koizumi. Bien qu'ils semblent ordinaires, chaque membre cache des secrets liés à la nature excentrique de Haruhi. Entraîné dans son monde chaotique, Kyon rejoint la SOS Brigade dans diverses aventures qui révèlent progressivement la véritable nature de leur énigmatique leader.

La République de San Magnolia prétend que sa guerre en cours contre l'Empire Giadian ne cause aucune victime, mais ce n'est que de la propagande. Alors que les Alba aux cheveux argentés des quatre-vingt-cinq secteurs de la République vivent en sécurité derrière des murs protecteurs, des personnes d'apparences différentes sont confinées dans une quatre-vingt-sixième faction secrète. Connues au sein de l'armée sous le nom de Eighty-Six, ces personnes sont contraintes de combattre la Légion autonome de l'Empire sous le commandement des « Handlers » républicains. Vladilena Milizé est affectée à l'escadron Spearhead en tant que nouvelle Handler, remplaçant la personne qui occupait ce poste précédemment. Rejetée par ses pairs pour être une partisane des Eighty-Six, elle continue à lutter contre une discrimination inhumaine. Shinei Nouzen est le capitaine de l'escadron Spearhead. Célèbre pour être le seul survivant de chaque escouade dans laquelle il a été, il insiste pour porter les noms et les souhaits de ses camarades tombés. Lorsque les destins de ces jeunes âmes de deux mondes différents se heurtent, cela allumera-t-il l'étincelle qui éclaire leur chemin vers le salut, ou brûleront-ils dans les flammes du désespoir ?

En l'an 2021, un virus parasitaire connu sous le nom de Gastrea a dévasté l'humanité, transformant les individus infectés en monstres terrifiants. La population survivante vit à l'intérieur de murs Monolith construits en Varanium, le seul matériau efficace contre les Gastrea. Pour faire face à cette menace existentielle, la Tendo Civil Security emploie des Initiators, de jeunes filles qui possèdent des traces du virus, leur conférant des capacités surhumaines. Chaque Initiator est associée à un Promoter, un adulte responsable de leur guidance et de leur protection. Ces duos entreprennent des missions pour éliminer les créatures engendrées par le virus. Le récit se concentre sur Enju Aihara, une Initiator, et son Promoter, Satomi Rentaro, alors qu'ils affrontent la crise grandissante des Gastrea à Tokyo.

En 1988, un garçon doté de pouvoirs psychiques déclenche une explosion catastrophique à Tokyo qui déclenche la Troisième Guerre mondiale. Pour éviter de nouvelles destructions, il est placé en détention et disparaît de la connaissance publique. Trois décennies plus tard, le Neo-Tokyo reconstruit est en proie à la guerre des gangs et au terrorisme antigouvernemental. Shoutarou Kaneda commande « les Capsules », une bande de délinquants célèbres pour leurs motos surdimensionnées personnalisées et leur rivalité permanente avec leurs rivaux, « les Clowns ». Lors d'une confrontation avec ces rivaux, le meilleur ami de Kaneda, Tetsuo Shima, entre en collision avec un individu possédant des pouvoirs psychiques qui s'est échappé d'un centre gouvernemental. Cet incident éveille chez Tetsuo des pouvoirs latents et dangereux. Alors que les autorités tentent de contenir cette nouvelle menace psychique avant qu'elle ne détruise à nouveau la ville, les capacités croissantes de Tetsuo le placent au centre du chaos.

Rintarou Okabe, l'excentrique savant fou autoproclamé, n'est plus qu'une coquille vide après le traumatisme d'avoir échoué à sauver Makise Kurisu. Submergé par la dépression, il abandonne son personnage de scientifique pour vivre comme un étudiant universitaire ordinaire, tentant d'enterrer les horreurs de ses expériences de voyage dans le temps tout en étant entouré d'amis qui ignorent son passé. Alors qu'il travaille comme réceptionniste dans un forum technologique, Okabe rencontre Maho Hiyajo, une jeune femme pleine d'entrain qui sert plus tard d'interprète pour une présentation du professeur Alexis Leskinen. Pendant l'événement, Alexis et Maho dévoilent Amadeus, une IA révolutionnaire capable de simuler les souvenirs, la personnalité et les particularités d'une personne avec une fidélité parfaite. Après la présentation, Okabe découvre que Maho et Alexis étaient des collègues universitaires de Kurisu et ont créé une simulation numérique d'elle. Chargé par Alexis de rechercher le comportement de l'IA, Okabe a l'opportunité d'interagir avec l'écho numérique de son amie perdue. Pris dans un dangereux enchevêtrement avec le passé, il doit affronter des réalités cruelles et naviguer à travers les conséquences périlleuses de l'altération du flux naturel du temps.