Synopsis
Il y a longtemps, une race appelée les Shadow Angels attaqua la Terre pour drainer l'énergie vitale de tous ses habitants. Par un miracle extraordinaire, les Shadow Angels tombèrent en dormance, permettant à l'humanité de survivre encore 12 000 ans sans les craindre. Cependant, 11 ans après une catastrophe connue sous le nom de Holy Genesis qui dévasta la planète, les Shadow Angels se réveillèrent et reprirent leurs assauts. Pour donner à l'humanité une chance de se battre, une organisation nommée DEAVA fut créée, et une arme robotique appelée Aquarion fut déployée. Pour libérer tout le potentiel d'Aquarion, trois pilotes doivent unir leurs cœurs, leurs corps et leurs âmes — un exploit que seuls quelques rares élus peuvent accomplir. Par conséquent, la recherche des soi-disant « Element Users » devint une priorité, dans l'espoir d'assurer l'avenir de l'humanité. Sousei no Aquarion suit l'histoire d'Apollo, un jeune homme presque sauvage élevé dans la pauvreté, considéré comme la réincarnation d'un héros légendaire. Après que son meilleur camarade ait été emmené par les Shadow Angels, Apollo décide de devenir pilote d'Aquarion. Pourra-t-il inverser le cours de la guerre et libérer l'humanité de la menace des Shadow Angels une fois pour toutes ?