Synopsis
Yuusei Fudou est déterminé à récupérer ce qui lui a été volé. Les duels ont évolué vers un nouveau niveau, et les Riding Duels sont désormais la forme de divertissement suprême pour les habitants de Neo Domino City. Ces batailles se déroulent sur des D-Wheels, des machines combinant les Duel Disks avec des motos. Après que Yuusei, un mécanicien talentueux, a construit son propre D-Wheel, son ancien ami Jack Atlas l'a volé, ainsi que la carte la plus précieuse de Yuusei, Stardust Dragon. Jack a alors abandonné leur ville natale délabrée de Satellite et s'est enfui à Neo Domino City. Au cours des deux années qui ont suivi, Jack a gravi les échelons jusqu'au sommet du monde des duels, tandis que Yuusei se préparait avec l'aide de ses amis. Maintenant que son nouveau D-Wheel est terminé, il se rend à Neo Domino City avec le seul objectif de retrouver Jack. Ni l'un ni l'autre ne réalisent que des forces bien plus grandes sont en jeu, avec des manipulateurs cachés contrôlant les événements depuis l'ombre.