Tiempo después de que un antiguo mal emergiera de las profundidades oceánicas, Joutarou Kuujou permanece en silencio dentro de una celda de una prisión japonesa. Aunque no ha cometido ningún crimen, se niega a salir, convencido de estar poseído por un espíritu maligno capaz de dañar a quienes lo rodean. Preocupada por su hijo, Holy Kuujou solicita a su padre, Joseph Joestar, que convenza a Joutarou de abandonar la cárcel. Joseph le revela a su nieto que dicho «espíritu maligno» es en realidad un Stand, una manifestación física del espíritu de lucha que puede adoptar diversas formas letales. Tras un intenso combate con Muhammad Avdol, amigo de Joseph, Joutarou es sacado a la fuerza de su celda y comienza a aprender a controlar el poder de su Stand. Sin embargo, cuando un Stand despierta dentro de Holy y amenaza con consumirla en 50 días, Joutarou, su abuelo y sus compañeros deben hallar y destruir al vampiro inmortal responsable de su condición. Deben viajar hasta El Cairo, Egipto, cruzando medio mundo, y enfrentarse a feroces usuarios de Stand que intentarán detenerlos en el camino. Si Joutarou y sus aliados fracasan en su misión, la humanidad se verá frente a un futuro oscuro.