Sinopsis
El Mundo Digital está sumido en un conflicto mientras el malévolo Ejército Bagra busca reunir las piezas de la Corona de Código, cuyo recolector está destinado a gobernar el reino. Esta siniestra facción es implacable en su búsqueda del poder de la corona. Taiki Kudou, un compasivo estudiante de secundaria al que le encanta el fútbol y ayuda a quienes están en apuros, ve su vida cambiar cuando escucha un grito de auxilio mientras está con sus amigos Akari Hinomoto y Zenjirou Tsurugi. En un callejón cercano, descubre a un Digimon gravemente herido llamado Shoutmon. Al utilizar un misterioso dispositivo conocido como Xros Loader, Taiki salva a Shoutmon pero es transportado simultáneamente al Mundo Digital junto con sus compañeros. Negándose a permitir que el Ejército Bagra triunfe, Taiki, Akari y Zenjirou se alían con Shoutmon y otros Digimon nativos para establecer el ejército Xros Heart. Mientras recorren el Mundo Digital para asegurar los fragmentos de la Corona de Código y derrotar a sus enemigos, pronto descubren que no son los únicos humanos envueltos en esta monstruosa guerra.