Sinopsis
Makoto Mizuhara, un prodigio de la ciencia en la escuela secundaria, se apresura a preparar su último invento para el festival escolar con su mejor amiga Nanami Jinnai a su lado. El hermano de Nanami, el maquinador presidente del consejo estudiantil Katsuhiko Jinnai, está siendo criticado por haber arruinado los preparativos del festival y sospecha que Makoto planea usurpar su cargo. Una noche, mientras Makoto, Nanami y su profesor Masamichi Fujisawa descansan, Jinnai se cuela en el laboratorio de ciencias y altera el dispositivo de Makoto. Esto desencadena un portal repentino que arroja a los cuatro a un mundo diferente. Al llegar, Makoto se encuentra bajo el ataque de un enjambre de monstruos insectoides enormes. Huyendo, se topa con Fujisawa y una joven llamada Rune Venus. Después de que Fujisawa ahuyenta a los monstruos, aparece una procesión de funcionarios en busca de Rune, su princesa. Le explican a Makoto y Fujisawa que este reino se llama El-Hazard y los escoltan al palacio del reino de Roshtaria. Aunque sus consejeros desconfían de los desconocidos, Rune los declara invitados y pronto se vuelve amigable con Makoto. Sin saber que Nanami y Jinnai también están en este mundo, Makoto se propone encontrar una manera de regresar a la Tierra.